본 대회은 MAIC 플랫폼에서 운영되므로 아래 링크에서 참가신청 및 대회참가를 수행해야 합니다.
참가신청 및 더보기 >> https://maic.or.kr/competitions/8/infomation
개요
서울대학교병원은 한국지능정보사회진흥원 (National Information society Agency, NIA)의 지원을 받아 연구자들에게 다양하고 신선한 기회를 제공하기 위해 특별한 데이터를 활용하는 해커톤을 개최합니다.
연구자들이 흔히 접할 수 없는 데이터(소아 병리영상과 성인 핵의학영상)를 제공하여 직접 분석에 활용해볼 수 있습니다. 또한 해커톤 이후 임상 의료진과의 협의를 통해 지속적인 융합연구를 진행할 수 있습니다. 많은 참여 부탁드립니다.
선천성 거대결장이라고도 불리는 허슈스프렁병(HIrschsprung disease)은 발생 중 장의 신경세포(신경절 세포) 중 일부 또는 전부가 제대로 발달하지 못하거나 장으로 이주하지 못해 장신경병증(enteric neuropathy)에 의해 발생합니다. 장의 운동이 멈추게 되고, 그에 따라 변의 진행이 안 되어 장이 대변으로 막혀 신생아나 어린이가 만성변비 및 복부 팽만으로 인한 통증에 시달리게 됩니다(정상적인 배변을 할 수 없음). 종종 장염이라는 심각한 감염이 발생할 수 있습니다.
이번 대회를 통하여 장의 근육층 사이에 있는 장신경절(enteric nerve ganglia)을 정확히 찾아 내는 AI 모델을 개발하면 관련 질병의 진단과 예후 예측에 도움을 줄 수 있습니다.
데이터
- 취득 방법: 소아병원에서 수술 후 진단을 위해 제작한 H&E 슬라이드 스캔 이미지 (Aperio GT450 x40배율 스캔 파일)
- 데이터 건수: 100건(명)
- 환자군 소개: 허슈스프렁병(HIrschsprung disease)은 발생 중 장의 신경세포(신경절 세포) 중 일부 또는 전부가 제대로 발달하지 못하거나 장으로 이주하지 못해 장신경병증(enteric neuropathy)에 의해 발생함. 장의 운동이 멈추게 되고, 그에 따라 변의 진행이 안 되어 장이 대변으로 막혀 신생아나 어린이가 만성변비 및 복부 팽만으로 인한 통증에 유발됩니다.
- 레이블링 데이터:
- xml: xml은 응용 프로그램간 정보를 쉽게 교환하기 위해 만든 데이터 포맷입니다. 제공 되는 xml에는 Layer별 좌표 정보가 annotation 되어 있습니다.
- Layer 3: proper muscle layer
- Layer 5: ganglion
- 정답 데이터: 검증데이터에 대한 Layer별 volume 값이 있는 csv파일
평가 규칙
장의 근육층 사이에 있는 장신경절(enteric nerve ganglia)을 정확히 찾아 내는 것입니다. (장신경절은 신경세포와 장교세포(enteric glia)로 구성되어 있으나 선천성 거대결장증의 경우 장신경절내에서 신경세포가 없거나 정상보다 적은 수만 있을 수 있습니다.)
제출 파일(csv) 예시
일정상세
1. 참가팀 모집: 9/16 - 10/13
- 참가 자격: 개인 혹은 9인 이내로 구성된 팀
- 참가 신청 방법: MAIC 홈페이지(https://maic.or.kr/)에서 등록 후 팀장이 아래 구글폼으로 입력
- 홈페이지내 팀원 모집을 통해 팀을 구성할 수 있으나 참가 신청과는 무관
2. 참가팀 심사: 10/13 - 10/17
- [평가 규칙]을 바탕으로 서류 심사 진행하여 예선 진출 20팀 선정
3. 대회 설명회: 10/18
- 예선 선정팀에 추후 별도 안내 예정
4. 예선: 10/18 - 11/7
- 세팅 기간: 2021.10.18 - 2021.10.24
- 대회 기간: 2021.10.25 - 2021.11.07
- 대회 규정: https://maic.or.kr/competitions/11/share-board/detail/201
- 의료 데이터 특성상 데이터는 반출이 불가능하며, 별도 이미지의 확인 또한 불가능함(본 대회에서 제공된 데이터만 사용)
5. 예선 심사: 11/8
- 재현성 검증 후 metric 순으로 본선 진출 10팀 선정(코드 및 모델 규격 확인 요망)
6. 본선 진출자 발표: 11/9
7. 본선: 11/10 - 11/23
- 세팅 기간: 2021.11.10 - 2021.11.12
- 대회 기간: 2021.11.13 - 2021.11.23
- 대회 규정: https://maic.or.kr/competitions/8/share-board/detail/200
- 의료 데이터 특성상 데이터는 반출이 불가능하며, 별도 이미지의 확인 또한 불가능함(본 대회에서 제공된 데이터만 사용)
- 타 기관 데이터 추가 제공 예정
8. 본선 심사: 11/23 - 11/26
- 재현성 검증 후 metric 순으로 최종 시상자 선정(코드 및 모델 규격 확인 요망)
- 우수팀의 경우 11월 23일까지 기술문서 제출 필수
- 기술문서 작성 요령: https://drive.google.com/file/d/1zf788v_P_cALQZvJK4jCkatwP_RwK-ZG/view?usp=sharing
- 기술문서 제출처: miaihelp@gmail.com
9. 최종 발표: 11/29
10. 시상식: 12/1
- 비대면으로 진행
- 수상자를 대상으로 추후 별도 안내 예정
상금
- 1등 - 금상: 300만원
- 2등 - 은상: 100만원
- 3등 - 은상: 50만원
- 4등 - 동상: 25만원 상품권
- 5등 - 동상: 25만원 상품권
